Regulatie van genexpressie: Inleiding
Genexpressie met een activerende transcriptiefactor
We beginnen met een eenvoudig model van eiwitproductie door een gen zonder feedback van het geproduceerde eiwit.
Stel dat eiwit A een activerende transcriptiefactor is die zich bindt aan de promotor van een gen X en een complex vormt. Zodra het complex gevormd wordt stimuleert het de productie van mRNA dat vervolgens in een translatieproces omgezet wordt in een eiwit X. Onderstaand schema vat de processen samen: De eerste reactie lijkt erg op een enzymatische reactie, waarbij de promotor als 'enzym' optreedt. Laten we het model nog wat versimpelen en veronderstellen dat de productie van het eiwit X door mRNA snel verloopt in vergelijking met de mRNA productie. Met andere woorden, wordt net als de reactiesnelheidsconstanten en groot verondersteld in vergelijking tot . Onder deze veronderstelling kunnen we het proces samenvatten met nieuwe reactiesnelheidsconstanten als Het is nu een 'enzymatische' eiwitproductie met de promotor van het eiwitproducerende gen als 'enzym'. We kunnen Michaelis-Menten kinetiek toepassen en voor de reactiesnelheid schrijven: waarbij de concentratie van het eiwit A is dat als activerende transcriptiefactor optreedt.
Opmerking De laatste formule voor de reactiesnelheid van eiwitvorming stemt overeen met Formule 8-5A voor de vormingsnelheid van het eiwit X in Alberts et al. (2015, editie 6, p. 513) als je in het boek neemt .